다양성을 통한 안정성 - 시스템 붕괴를 막기 위한 필수적 속성
나는 박사 과정 시절, 여러 과에서 다양한 수업을 들었는데, 기억에 남는 수업 중 하나가 물리과에서 개설한 시스템 생물학이었다. 아무래도 물리과에서 개설한 과목이다 보니, 다소 수학과 컴퓨터 시뮬레이션에 치중한 코스웤이긴 했지만, 그래도 게임 이론, 생태학, 비선형 동역학, kinetic Monte carlo (KMC), synthetic biology, biological/neural signal trasduction 등 굉장히 흥미롭고 다채로운 개념을 집중적으로 배우고 컴퓨터로 구현하며 익혔던 기억이 난다. 그중에서도 몇몇 방법론은 지금도 내 연구에서 다양하게 변용되어 활용되고 있다. 예를 들어 KMC는 시스템 생물학뿐만 아니라, 원래 Daniel Gillespie가 1970년대에 개발했던 확률론적 ..
2021. 10. 26.